Roux-en-Y Gastrik Bypass olarak da adlandırılan gastrik bypass ameliyatı üç adımda yapılmaktadır. İlk olarak cerrah midenizi zımbalayarak üst bölümde küçük bir kese oluşturur. Zımba midenizin çok daha küçük olmasını sağlar. Bu nedenle daha az yemek yemeye sebep olur çünkü daha erken tok hissedersiniz.
Daha sonra cerrah ince bağırsağınızı ikiye böler ve alt kısmı doğrudan küçük mide kesesine bağlar. Yiyecekler midenizin çoğunu ve ince bağırsağınızın üst kısmını atlayarak vücudunuz daha az kalori emilmesini sağlar.
Cerrah daha sonra ince bağırsağın üst kısmını ince bağırsağın alt kısmından daha aşağıda yeni bir konuma yeniden bağlar. Bu yer değiştirme midede bulunan sindirim sıvılarının ince bağırsağın baypas edilmiş kısmından ince bağırsağın alt kısmına akmasına izin verir. Bu nedenle yiyecekler tamamen sindirilebilir. Baypas gastrointestinal sistemdeki hormonları, bakterileri ve diğer maddeleri değiştirdiği için hastanın iştahı ve metabolizması etkilenebilir. Gastrik baypası tersine çevirmek zordur ancak bir cerrah tıbbi olarak gerekliyse bunu yapabilir.